Soile Isokosken uravalinta oli alkuun epävarma, sillä hän tuli vanhoillis-lestadiolaisesta kodista ja pappi-isä olisi suonut tyttärelleen porvarillisemman ammatin. Lauluopinnot hän kuitenkin aloitti Raahen musiikkiopistossa Sirkka Mattilan johdolla, siirtyen sitten kirkkomusiikkia opiskelemaan Kuopioon. Kanttoriksi hän valmistui 1984, jolloin hän lauloi myös diplomin.

Kesäkuussa 1985 Soile Isokoski aloitti Paavolan kanttorina.

Ensikonsertin Soile Isokoski antoi kevättalvella 1986.

Läpimurto alkoi Lappeenrannan laulukilpailujen voitolla tammikuussa 1987. Samana vuonna hän osallistui BBC:n Singer of the World-kilpailuun Cardiffissa, tuloksena toinen sija.

Soile Isokosken menestysten sarja jatkui 1988 Elly Ameling-kilpailun voitolla. 1990 Hän niinikään sai 1. palkinnon Tokion kansainvälisessä laulukilpailussa.

Suomen Kansallisoopperaan Soile Isokoski solmi sopimuksen 1987-1994; ensimmäinen oopperarooli oli La Bohemen Mimi.

1990-luvulla Soile Isokoski aloitti levyttämisen; levyjä on julkaistu yli 50 kappaletta. Pitkästä luettelosta poimittakoon Sibeliuksen Luonnotar Leif Segerstamin ja Helsingin Filharmonian kanssa 2006, Jouni Kankaisen Luukas-passio, Rukoushetki päivän päättyessä, jonka hän levytti baritoni Esa Ruuttusen kanssa 2004, Sibeliuksen Kullervo-sinfonia Tanskan Radion sinfoniaorkesterin ja Leif Segerstamin kanssa, baritonisolistina Raimo Laukka 1995, sekä samana vuonna Isokosken kantaesittämä, Ralf Gothonin teos "Härkä ja hänen paimenensa". Isokosken parina laulaa Jorma Hynninen, säveltäjän johtaessa kamariorkesteria.

Soile Isokoskelle myönnettiin Sibelius-mitali 1995, Suomen Kulttuurirahaston palkinto 2001 ja Pro Finlandia-mitali 2002. Gramophone Editor's Choice Award annettiin äänitteestä, jolla kuullaan Richard Straussin Orkesterilauluista Neljä Viimeistä laulua. Sama äänite sai samana vuonna myös Janne-palkinnon. Samana vuonna Soile Isokoski lauloi premiäärinsä Metropolitan-oopperassa, jolloin hän esitti Mozartin Figaron Häät-oopperan Kreivittären roolin.

Säveltaiteen valtionpalkinto Soile Isokoskelle myönnettiin 2005

Ylioppilaskunnan Laulajien kanssa äänitetty joululevy "Jouluyö, juhlayö" saavutti kultalevyn 2006.

Sibeliuksen Luonnotar Orchestral Songs saavutti MIDEM Classical Award-palkinnon 2007. Samana vuonna Soile Isokoskelle myönnettiin toistamiseen Sibelius-mitali.

Soile Isokosken pitkästä rooliluettelosta poimittakoon Mozartin Cosi fan tutte-oopperan Fiordiligi, Wagnerin Lohengrin-oopperan Elsa ja Richard Straussin Ruusuritarin Marsalkatar.

Kantaesityksiä ovat olleet mm. Olli Kortekankaan "Syvä ilo" joulukuussa 1997 ja saman säveltäjän "Tämä hetki - Dieser Augenblick" pienyhtyeelle 2004. Heinäkuussa 2007 hän kantaesitti Jouni Kaipaisen teoksen op. 67, En skål för alla kvinnors ära.